生物信息学研究中高通量数据分析的一些套路
研究目的:从大量数据中筛选出感兴趣的基因(包括编码基因和非编码基因)。通过下列步骤进行分析和验证:
1.通过生物信息学的方法筛选出候补集合。(中间包括滤除各种噪声或者误差。)
2.定性分析:Reverse Transcription PCR(RT)。看看有没有。
3.定量分析:Quantification PCR。有的话多不多。
4.定全长。RACE。
5.生物功能研究。
可以采用敲除和过表达的方式,并使用chip-seq免疫共沉淀技术,找出该基因和已知蛋白的关系。如果找到已知的蛋白,可以继续研究和该蛋白相互作用的蛋白以及target等的研究。如果效果比较好,可以使用细胞模型,如果细胞模型比较好,可以继续上动物模型,如果动物模型好,可以继续上临床。这样一篇新英格兰级别的文章就诞生了。呵呵。
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