软件与生物之基因芯片
1、基因芯片综合分析软件。
ArrayVision7.0一种功能强大的商业版基因芯片分析软件,不仅可以进行图像分析,还可以进行数据处理,方便protocol的管理功能强大,商业版正式版:6900美元。
Arraypro4.0MediaCybernetics公司的产品,该公司的gelpro,imagepro一直以精确成为同类产品中的佼佼者,相信arraypro也不会差。
phoretix?ArrayNonlinearDynamics公司的基因片综合分析软件。
J-express挪威Bergen大学编写,是一个用JAVA语言写的应用程序,界面清晰漂亮,用来分析微矩阵(microarray)实验获得的.基因表达数据,需要下载安装JAVA运行环境JRE1.2后(5.1M)后,才能运行。
2、基因芯片阅读图像分析软件。
ScanAlyze2.44,斯坦福的基因芯片基因芯片阅读软件,进行微矩阵荧光图像分析,包括半自动定义格栅与像素点分析。输出为分隔的文本格式,可很容易地转化为任何数据库。
3、基因芯片数据分析软件。
Cluster斯坦福的对大量微矩阵数据组进行各种簇(Cluster)分析与其它各种处理的软件。SAMSignificanceAnalysisofMicroarrays的缩写,微矩阵显著性分析软件,EXCEL软件的插件,由Stanford大学编制。
4.基因芯片聚类图形显示。
TreeVieiga2.0的换代产品,accelrys公司Discoverystudio系列,accelrys公司的insightII,GCG是业内蛋白分析和核酸分析的权威软件,DSgene是GCG的个人机简版,功能强大,而且可以直接与GCG服务器相连。由于受到vectorNTI的界面影响,DSgene与Omiga2.0相比界面有了很大的改变。
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