关于辞职的问题，求指导

我在一个研究所上班，签了3年合同(违约金和培训费1W)，现在不到一年就想辞职，部门主任的意见是做完某某项目结点后才能交接工作，我填写的离职申请表的时间是今年4月13日，部门主任的意见签的.时间是4月21日，按照劳动法，提前一个月申请辞职，一个月后单位不办理，就可以解约。但我们单位人力资源部的答复是：劳动合同上有一条，从事重大项目不能违法劳动合同，要求我按照部门主任的意见执行。可这个项目节点都不知道能拖到什么时候去了，我着急走因为已经有另外一家单位要求入职了，而且要求有离职证明。真不知道该怎么办。怕得罪领导了，给我来个按保密协定办(单位内脱秘三个月)，我就惨了，哎 郁闷的人呐 哪位高手能帮帮，小弟跪谢了，