最近原国企说寄档案时忘了放我的实习和辞职证明

我刚工作不到一年，而国企实习期的.一年间辞职的。现在一所国家属大学工作。
主要困惑是，辞职证明是通过任免文件的形式写的（上有××单位任免通知字样），内容是我因个人原因提出辞职，原单位同意并批准解除劳动关系。他们说会涉及到一年后的干部身份转正问题，还说建立了劳动关系就相应有一个解除手续，这样说是否合理？即使合理，请问这种用“任免文件”形式说我“自动辞职”的文件，从人事制度上说是否应当放进档案？放进去好还是不放好？即使应当放进去，现在档案已经转了，新的人才市场会同意接收吗？
我还有一位同事情况和我一样，他现在所在工作单位也是学校，但是原单位说他在学校没有编制，所以不能和我一样操作，还要再做处理。而我在现在单位是有编制的，所以要这样操作。是这样吗？